Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms