Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DUSP1P28562 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms