Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms