Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLD1P28340 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLD1P28340 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLD1P28340 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLD1P28340 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLD1P28340 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLD1P28340 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLD1P28340 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLD1P28340 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLD1P28340 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLD1P28340 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLD1P28340 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLD1P28340 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLD1P28340 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLD1P28340 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLD1P28340 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLD1P28340 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLD1P28340 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLD1P28340 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLD1P28340 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLD1P28340 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLD1P28340 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLD1P28340 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLD1P28340 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLD1P28340 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLD1P28340 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLD1P28340 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLD1P28340 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLD1P28340 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLD1P28340 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLD1P28340 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLD1P28340 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
POLD1P28340 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
POLD1P28340 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLD1P28340 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLD1P28340 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLD1P28340 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLD1P28340 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLD1P28340 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLD1P28340 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLD1P28340 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLD1P28340 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLD1P28340 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLD1P28340 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLD1P28340 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLD1P28340 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
POLD1P28340 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLD1P28340 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
POLD1P28340 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLD1P28340 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLD1P28340 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
POLD1P28340 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLD1P28340 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLD1P28340 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLD1P28340 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLD1P28340 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLD1P28340 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLD1P28340 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLD1P28340 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLD1P28340 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLD1P28340 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLD1P28340 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLD1P28340 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLD1P28340 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLD1P28340 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLD1P28340 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLD1P28340 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLD1P28340 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLD1P28340 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLD1P28340 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
POLD1P28340 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLD1P28340 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLD1P28340 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLD1P28340 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLD1P28340 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLD1P28340 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLD1P28340 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLD1P28340 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLD1P28340 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLD1P28340 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLD1P28340 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLD1P28340 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLD1P28340 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLD1P28340 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLD1P28340 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLD1P28340 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLD1P28340 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLD1P28340 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLD1P28340 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLD1P28340 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
POLD1P28340 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLD1P28340 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLD1P28340 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLD1P28340 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLD1P28340 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
POLD1P28340 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLD1P28340 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLD1P28340 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLD1P28340 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLD1P28340 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms