Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LMO2P25791 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LMO2P25791 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LMO2P25791 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LMO2P25791 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LMO2P25791 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
LMO2P25791 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LMO2P25791 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
LMO2P25791 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
LMO2P25791 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LMO2P25791 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LMO2P25791 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LMO2P25791 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
LMO2P25791 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LMO2P25791 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LMO2P25791 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LMO2P25791 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LMO2P25791 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LMO2P25791 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LMO2P25791 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LMO2P25791 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LMO2P25791 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LMO2P25791 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LMO2P25791 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LMO2P25791 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LMO2P25791 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LMO2P25791 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LMO2P25791 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LMO2P25791 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LMO2P25791 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LMO2P25791 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LMO2P25791 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LMO2P25791 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LMO2P25791 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LMO2P25791 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LMO2P25791 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LMO2P25791 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
LMO2P25791 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LMO2P25791 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LMO2P25791 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LMO2P25791 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LMO2P25791 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LMO2P25791 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LMO2P25791 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LMO2P25791 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LMO2P25791 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LMO2P25791 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LMO2P25791 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LMO2P25791 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LMO2P25791 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LMO2P25791 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LMO2P25791 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LMO2P25791 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LMO2P25791 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LMO2P25791 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LMO2P25791 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LMO2P25791 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LMO2P25791 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LMO2P25791 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LMO2P25791 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LMO2P25791 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LMO2P25791 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
LMO2P25791 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LMO2P25791 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LMO2P25791 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LMO2P25791 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LMO2P25791 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LMO2P25791 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LMO2P25791 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LMO2P25791 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LMO2P25791 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LMO2P25791 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LMO2P25791 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LMO2P25791 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LMO2P25791 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
LMO2P25791 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LMO2P25791 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LMO2P25791 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
LMO2P25791 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LMO2P25791 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LMO2P25791 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LMO2P25791 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LMO2P25791 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LMO2P25791 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMO2P25791 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMO2P25791 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMO2P25791 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMO2P25791 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMO2P25791 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMO2P25791 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
LMO2P25791 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMO2P25791 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMO2P25791 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMO2P25791 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMO2P25791 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMO2P25791 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMO2P25791 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
LMO2P25791 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMO2P25791 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMO2P25791 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms