Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CTSSP25774 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CTSSP25774 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTSSP25774 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTSSP25774 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTSSP25774 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTSSP25774 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTSSP25774 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTSSP25774 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTSSP25774 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTSSP25774 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CTSSP25774 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTSSP25774 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTSSP25774 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTSSP25774 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CTSSP25774 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTSSP25774 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTSSP25774 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTSSP25774 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CTSSP25774 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTSSP25774 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTSSP25774 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTSSP25774 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTSSP25774 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTSSP25774 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTSSP25774 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTSSP25774 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTSSP25774 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTSSP25774 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTSSP25774 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTSSP25774 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTSSP25774 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTSSP25774 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTSSP25774 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTSSP25774 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTSSP25774 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTSSP25774 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTSSP25774 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTSSP25774 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTSSP25774 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTSSP25774 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTSSP25774 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTSSP25774 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTSSP25774 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTSSP25774 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTSSP25774 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTSSP25774 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTSSP25774 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTSSP25774 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTSSP25774 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTSSP25774 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTSSP25774 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTSSP25774 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTSSP25774 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTSSP25774 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTSSP25774 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTSSP25774 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTSSP25774 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTSSP25774 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTSSP25774 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTSSP25774 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTSSP25774 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTSSP25774 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CTSSP25774 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTSSP25774 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTSSP25774 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTSSP25774 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTSSP25774 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTSSP25774 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTSSP25774 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTSSP25774 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTSSP25774 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CTSSP25774 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CTSSP25774 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTSSP25774 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTSSP25774 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTSSP25774 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTSSP25774 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTSSP25774 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTSSP25774 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTSSP25774 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTSSP25774 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTSSP25774 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTSSP25774 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTSSP25774 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTSSP25774 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTSSP25774 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTSSP25774 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTSSP25774 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTSSP25774 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTSSP25774 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTSSP25774 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CTSSP25774 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTSSP25774 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTSSP25774 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTSSP25774 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTSSP25774 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTSSP25774 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CTSSP25774 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTSSP25774 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms