Protein–RNA interactions for Protein: P24821

TNC, Tenascin, humanhuman

Predictions only

Length 2,201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNCP24821 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNCP24821 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNCP24821 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNCP24821 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNCP24821 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNCP24821 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TNCP24821 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNCP24821 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNCP24821 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNCP24821 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNCP24821 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNCP24821 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNCP24821 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNCP24821 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNCP24821 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNCP24821 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNCP24821 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TNCP24821 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNCP24821 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TNCP24821 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNCP24821 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNCP24821 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNCP24821 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNCP24821 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNCP24821 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TNCP24821 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNCP24821 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNCP24821 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNCP24821 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNCP24821 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNCP24821 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNCP24821 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNCP24821 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNCP24821 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNCP24821 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNCP24821 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TNCP24821 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TNCP24821 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNCP24821 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNCP24821 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNCP24821 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNCP24821 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNCP24821 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNCP24821 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNCP24821 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNCP24821 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNCP24821 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNCP24821 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNCP24821 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNCP24821 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNCP24821 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNCP24821 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNCP24821 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNCP24821 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNCP24821 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNCP24821 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNCP24821 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNCP24821 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNCP24821 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNCP24821 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TNCP24821 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNCP24821 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNCP24821 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNCP24821 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNCP24821 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNCP24821 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNCP24821 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNCP24821 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNCP24821 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNCP24821 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNCP24821 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNCP24821 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNCP24821 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNCP24821 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNCP24821 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNCP24821 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNCP24821 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNCP24821 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNCP24821 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNCP24821 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNCP24821 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNCP24821 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNCP24821 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TNCP24821 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNCP24821 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TNCP24821 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNCP24821 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNCP24821 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNCP24821 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNCP24821 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNCP24821 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNCP24821 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNCP24821 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNCP24821 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNCP24821 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNCP24821 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNCP24821 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNCP24821 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNCP24821 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNCP24821 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms