Protein–RNA interactions for Protein: P23634

ATP2B4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B4P23634 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP2B4P23634 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2B4P23634 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms