Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRZ1P23471 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRZ1P23471 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRZ1P23471 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRZ1P23471 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRZ1P23471 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRZ1P23471 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRZ1P23471 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRZ1P23471 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRZ1P23471 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRZ1P23471 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRZ1P23471 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRZ1P23471 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRZ1P23471 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRZ1P23471 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRZ1P23471 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRZ1P23471 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRZ1P23471 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRZ1P23471 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRZ1P23471 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRZ1P23471 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRZ1P23471 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRZ1P23471 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRZ1P23471 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRZ1P23471 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRZ1P23471 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRZ1P23471 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRZ1P23471 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRZ1P23471 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRZ1P23471 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRZ1P23471 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRZ1P23471 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRZ1P23471 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRZ1P23471 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRZ1P23471 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRZ1P23471 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRZ1P23471 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRZ1P23471 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRZ1P23471 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRZ1P23471 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRZ1P23471 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRZ1P23471 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRZ1P23471 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRZ1P23471 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRZ1P23471 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRZ1P23471 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRZ1P23471 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRZ1P23471 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRZ1P23471 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRZ1P23471 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRZ1P23471 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRZ1P23471 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRZ1P23471 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRZ1P23471 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRZ1P23471 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRZ1P23471 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRZ1P23471 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRZ1P23471 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRZ1P23471 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRZ1P23471 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRZ1P23471 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRZ1P23471 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRZ1P23471 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRZ1P23471 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRZ1P23471 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRZ1P23471 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRZ1P23471 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRZ1P23471 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRZ1P23471 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRZ1P23471 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRZ1P23471 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRZ1P23471 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRZ1P23471 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRZ1P23471 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRZ1P23471 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRZ1P23471 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRZ1P23471 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRZ1P23471 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRZ1P23471 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRZ1P23471 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
PTPRZ1P23471 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRZ1P23471 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRZ1P23471 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRZ1P23471 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRZ1P23471 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRZ1P23471 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRZ1P23471 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRZ1P23471 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRZ1P23471 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRZ1P23471 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRZ1P23471 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRZ1P23471 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRZ1P23471 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRZ1P23471 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRZ1P23471 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRZ1P23471 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRZ1P23471 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRZ1P23471 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRZ1P23471 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRZ1P23471 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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