Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRDP23468 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
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