Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPRBP23467 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRBP23467 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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