Protein–RNA interactions for Protein: P22676

CALB2, Calretinin, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB2P22676 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CALB2P22676 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CALB2P22676 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CALB2P22676 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CALB2P22676 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CALB2P22676 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CALB2P22676 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CALB2P22676 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CALB2P22676 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CALB2P22676 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CALB2P22676 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CALB2P22676 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CALB2P22676 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CALB2P22676 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CALB2P22676 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CALB2P22676 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CALB2P22676 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CALB2P22676 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CALB2P22676 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CALB2P22676 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CALB2P22676 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALB2P22676 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALB2P22676 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALB2P22676 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALB2P22676 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALB2P22676 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALB2P22676 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CALB2P22676 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALB2P22676 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALB2P22676 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALB2P22676 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALB2P22676 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALB2P22676 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CALB2P22676 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALB2P22676 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALB2P22676 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CALB2P22676 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALB2P22676 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALB2P22676 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALB2P22676 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALB2P22676 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALB2P22676 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALB2P22676 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALB2P22676 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALB2P22676 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALB2P22676 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALB2P22676 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALB2P22676 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALB2P22676 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALB2P22676 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALB2P22676 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALB2P22676 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALB2P22676 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALB2P22676 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CALB2P22676 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALB2P22676 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALB2P22676 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALB2P22676 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALB2P22676 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALB2P22676 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CALB2P22676 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALB2P22676 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALB2P22676 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALB2P22676 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALB2P22676 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALB2P22676 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALB2P22676 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CALB2P22676 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALB2P22676 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CALB2P22676 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALB2P22676 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALB2P22676 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALB2P22676 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALB2P22676 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALB2P22676 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALB2P22676 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALB2P22676 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALB2P22676 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CALB2P22676 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALB2P22676 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALB2P22676 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CALB2P22676 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CALB2P22676 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CALB2P22676 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CALB2P22676 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CALB2P22676 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CALB2P22676 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CALB2P22676 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CALB2P22676 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CALB2P22676 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CALB2P22676 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CALB2P22676 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CALB2P22676 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CALB2P22676 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CALB2P22676 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CALB2P22676 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CALB2P22676 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CALB2P22676 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CALB2P22676 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CALB2P22676 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms