Protein–RNA interactions for Protein: P20337

RAB3B, Ras-related protein Rab-3B, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3BP20337 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB3BP20337 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms