Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDSP20132 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDSP20132 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDSP20132 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDSP20132 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDSP20132 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDSP20132 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDSP20132 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDSP20132 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDSP20132 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDSP20132 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDSP20132 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDSP20132 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDSP20132 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDSP20132 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDSP20132 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SDSP20132 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDSP20132 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDSP20132 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDSP20132 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDSP20132 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDSP20132 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDSP20132 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDSP20132 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SDSP20132 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDSP20132 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDSP20132 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDSP20132 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDSP20132 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDSP20132 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDSP20132 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDSP20132 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDSP20132 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDSP20132 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDSP20132 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDSP20132 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDSP20132 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDSP20132 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDSP20132 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SDSP20132 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SDSP20132 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDSP20132 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDSP20132 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDSP20132 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDSP20132 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDSP20132 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDSP20132 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDSP20132 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDSP20132 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDSP20132 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SDSP20132 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDSP20132 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDSP20132 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDSP20132 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDSP20132 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDSP20132 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDSP20132 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDSP20132 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDSP20132 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDSP20132 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDSP20132 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDSP20132 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDSP20132 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDSP20132 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDSP20132 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDSP20132 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDSP20132 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDSP20132 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDSP20132 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDSP20132 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDSP20132 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDSP20132 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDSP20132 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SDSP20132 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SDSP20132 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SDSP20132 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDSP20132 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDSP20132 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDSP20132 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDSP20132 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDSP20132 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDSP20132 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDSP20132 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDSP20132 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDSP20132 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDSP20132 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDSP20132 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDSP20132 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDSP20132 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDSP20132 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDSP20132 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDSP20132 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDSP20132 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDSP20132 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDSP20132 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDSP20132 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDSP20132 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDSP20132 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDSP20132 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SDSP20132 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms