Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRAP18433 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRAP18433 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRAP18433 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRAP18433 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRAP18433 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRAP18433 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRAP18433 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRAP18433 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRAP18433 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRAP18433 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRAP18433 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRAP18433 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRAP18433 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRAP18433 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRAP18433 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRAP18433 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRAP18433 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRAP18433 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRAP18433 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRAP18433 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRAP18433 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRAP18433 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRAP18433 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRAP18433 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRAP18433 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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PTPRAP18433 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRAP18433 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRAP18433 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRAP18433 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRAP18433 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRAP18433 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRAP18433 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRAP18433 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRAP18433 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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PTPRAP18433 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPRAP18433 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPRAP18433 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
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PTPRAP18433 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRAP18433 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRAP18433 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRAP18433 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRAP18433 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRAP18433 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRAP18433 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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