Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DESP17661 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DESP17661 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DESP17661 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
DESP17661 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DESP17661 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DESP17661 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DESP17661 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DESP17661 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DESP17661 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DESP17661 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DESP17661 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DESP17661 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DESP17661 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DESP17661 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DESP17661 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DESP17661 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DESP17661 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DESP17661 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DESP17661 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DESP17661 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DESP17661 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DESP17661 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DESP17661 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DESP17661 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DESP17661 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DESP17661 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DESP17661 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DESP17661 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DESP17661 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DESP17661 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DESP17661 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DESP17661 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DESP17661 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DESP17661 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DESP17661 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DESP17661 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DESP17661 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DESP17661 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DESP17661 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DESP17661 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DESP17661 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DESP17661 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
DESP17661 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DESP17661 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DESP17661 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DESP17661 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DESP17661 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DESP17661 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DESP17661 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DESP17661 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DESP17661 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DESP17661 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DESP17661 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DESP17661 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DESP17661 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DESP17661 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DESP17661 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DESP17661 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DESP17661 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DESP17661 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DESP17661 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DESP17661 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DESP17661 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DESP17661 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
DESP17661 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
DESP17661 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DESP17661 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DESP17661 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DESP17661 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DESP17661 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DESP17661 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
DESP17661 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
DESP17661 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
DESP17661 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DESP17661 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DESP17661 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DESP17661 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DESP17661 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DESP17661 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DESP17661 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DESP17661 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DESP17661 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DESP17661 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DESP17661 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DESP17661 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DESP17661 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DESP17661 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DESP17661 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DESP17661 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DESP17661 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DESP17661 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DESP17661 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DESP17661 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DESP17661 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DESP17661 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DESP17661 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DESP17661 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DESP17661 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DESP17661 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms