Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VEGFAP15692 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms