Protein–RNA interactions for Protein: P13747

HLA-E, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-EP13747 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-EP13747 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-EP13747 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms