Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HKR1P10072 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HKR1P10072 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HKR1P10072 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HKR1P10072 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HKR1P10072 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HKR1P10072 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HKR1P10072 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HKR1P10072 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HKR1P10072 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HKR1P10072 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HKR1P10072 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HKR1P10072 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HKR1P10072 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HKR1P10072 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HKR1P10072 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HKR1P10072 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HKR1P10072 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HKR1P10072 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HKR1P10072 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HKR1P10072 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HKR1P10072 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HKR1P10072 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HKR1P10072 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HKR1P10072 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HKR1P10072 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HKR1P10072 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HKR1P10072 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HKR1P10072 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HKR1P10072 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HKR1P10072 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HKR1P10072 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HKR1P10072 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HKR1P10072 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HKR1P10072 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HKR1P10072 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HKR1P10072 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HKR1P10072 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HKR1P10072 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HKR1P10072 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HKR1P10072 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HKR1P10072 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HKR1P10072 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HKR1P10072 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HKR1P10072 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HKR1P10072 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HKR1P10072 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HKR1P10072 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HKR1P10072 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HKR1P10072 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HKR1P10072 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HKR1P10072 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HKR1P10072 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HKR1P10072 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HKR1P10072 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HKR1P10072 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HKR1P10072 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HKR1P10072 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HKR1P10072 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HKR1P10072 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HKR1P10072 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HKR1P10072 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HKR1P10072 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HKR1P10072 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HKR1P10072 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HKR1P10072 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HKR1P10072 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HKR1P10072 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HKR1P10072 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HKR1P10072 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HKR1P10072 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HKR1P10072 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HKR1P10072 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HKR1P10072 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HKR1P10072 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HKR1P10072 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HKR1P10072 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HKR1P10072 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HKR1P10072 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HKR1P10072 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HKR1P10072 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HKR1P10072 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HKR1P10072 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HKR1P10072 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HKR1P10072 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HKR1P10072 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HKR1P10072 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HKR1P10072 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HKR1P10072 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HKR1P10072 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HKR1P10072 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HKR1P10072 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HKR1P10072 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HKR1P10072 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HKR1P10072 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HKR1P10072 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HKR1P10072 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HKR1P10072 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HKR1P10072 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HKR1P10072 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms