Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
U2AF1L5P0DN76 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
U2AF1L5P0DN76 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
U2AF1L5P0DN76 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
U2AF1L5P0DN76 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
U2AF1L5P0DN76 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
U2AF1L5P0DN76 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
U2AF1L5P0DN76 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
U2AF1L5P0DN76 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
U2AF1L5P0DN76 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
U2AF1L5P0DN76 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
U2AF1L5P0DN76 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
U2AF1L5P0DN76 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
U2AF1L5P0DN76 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
U2AF1L5P0DN76 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
U2AF1L5P0DN76 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
U2AF1L5P0DN76 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
U2AF1L5P0DN76 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
U2AF1L5P0DN76 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
U2AF1L5P0DN76 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
U2AF1L5P0DN76 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
U2AF1L5P0DN76 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
U2AF1L5P0DN76 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
U2AF1L5P0DN76 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
U2AF1L5P0DN76 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
U2AF1L5P0DN76 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
U2AF1L5P0DN76 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
U2AF1L5P0DN76 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
U2AF1L5P0DN76 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
U2AF1L5P0DN76 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms