Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
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