Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJB1P08034 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJB1P08034 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJB1P08034 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJB1P08034 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJB1P08034 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJB1P08034 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJB1P08034 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJB1P08034 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJB1P08034 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJB1P08034 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJB1P08034 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJB1P08034 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJB1P08034 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJB1P08034 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJB1P08034 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJB1P08034 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJB1P08034 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJB1P08034 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJB1P08034 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJB1P08034 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJB1P08034 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJB1P08034 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJB1P08034 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJB1P08034 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJB1P08034 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJB1P08034 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJB1P08034 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJB1P08034 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJB1P08034 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJB1P08034 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJB1P08034 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJB1P08034 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJB1P08034 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJB1P08034 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJB1P08034 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJB1P08034 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJB1P08034 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJB1P08034 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJB1P08034 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJB1P08034 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJB1P08034 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJB1P08034 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJB1P08034 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJB1P08034 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJB1P08034 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJB1P08034 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJB1P08034 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJB1P08034 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJB1P08034 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GJB1P08034 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJB1P08034 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJB1P08034 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GJB1P08034 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GJB1P08034 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GJB1P08034 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJB1P08034 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJB1P08034 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJB1P08034 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJB1P08034 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJB1P08034 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJB1P08034 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJB1P08034 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJB1P08034 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJB1P08034 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJB1P08034 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJB1P08034 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJB1P08034 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJB1P08034 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJB1P08034 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJB1P08034 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJB1P08034 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJB1P08034 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJB1P08034 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJB1P08034 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJB1P08034 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJB1P08034 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJB1P08034 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJB1P08034 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJB1P08034 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GJB1P08034 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJB1P08034 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GJB1P08034 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJB1P08034 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GJB1P08034 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GJB1P08034 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJB1P08034 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJB1P08034 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJB1P08034 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJB1P08034 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJB1P08034 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJB1P08034 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJB1P08034 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJB1P08034 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJB1P08034 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJB1P08034 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GJB1P08034 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GJB1P08034 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GJB1P08034 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GJB1P08034 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms