Protein–RNA interactions for Protein: P05090

APOD, Apolipoprotein D, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APODP05090 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APODP05090 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APODP05090 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APODP05090 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APODP05090 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APODP05090 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APODP05090 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APODP05090 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APODP05090 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APODP05090 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APODP05090 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APODP05090 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APODP05090 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APODP05090 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APODP05090 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APODP05090 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APODP05090 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APODP05090 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APODP05090 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APODP05090 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APODP05090 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APODP05090 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APODP05090 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
APODP05090 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
APODP05090 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APODP05090 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APODP05090 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
APODP05090 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APODP05090 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
APODP05090 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
APODP05090 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
APODP05090 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APODP05090 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
APODP05090 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APODP05090 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APODP05090 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APODP05090 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APODP05090 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APODP05090 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APODP05090 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APODP05090 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APODP05090 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APODP05090 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APODP05090 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APODP05090 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APODP05090 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APODP05090 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APODP05090 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
APODP05090 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APODP05090 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APODP05090 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APODP05090 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APODP05090 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APODP05090 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APODP05090 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APODP05090 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APODP05090 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
APODP05090 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APODP05090 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APODP05090 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APODP05090 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APODP05090 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APODP05090 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APODP05090 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APODP05090 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APODP05090 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APODP05090 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APODP05090 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APODP05090 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APODP05090 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APODP05090 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APODP05090 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APODP05090 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APODP05090 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APODP05090 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APODP05090 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
APODP05090 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
APODP05090 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APODP05090 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APODP05090 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APODP05090 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
APODP05090 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APODP05090 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APODP05090 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APODP05090 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APODP05090 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APODP05090 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APODP05090 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APODP05090 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
APODP05090 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APODP05090 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APODP05090 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
APODP05090 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APODP05090 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APODP05090 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APODP05090 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APODP05090 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
APODP05090 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APODP05090 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APODP05090 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms