Protein–RNA interactions for Protein: P01563

IFNA2, Interferon alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA2P01563 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFNA2P01563 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFNA2P01563 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFNA2P01563 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms