Protein–RNA interactions for Protein: O96018

APBA3, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA3O96018 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APBA3O96018 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APBA3O96018 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APBA3O96018 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APBA3O96018 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APBA3O96018 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APBA3O96018 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APBA3O96018 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APBA3O96018 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APBA3O96018 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APBA3O96018 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APBA3O96018 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APBA3O96018 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
APBA3O96018 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APBA3O96018 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APBA3O96018 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APBA3O96018 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APBA3O96018 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
APBA3O96018 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APBA3O96018 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
APBA3O96018 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APBA3O96018 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APBA3O96018 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APBA3O96018 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APBA3O96018 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APBA3O96018 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APBA3O96018 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APBA3O96018 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APBA3O96018 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
APBA3O96018 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APBA3O96018 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APBA3O96018 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
APBA3O96018 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APBA3O96018 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APBA3O96018 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APBA3O96018 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APBA3O96018 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APBA3O96018 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APBA3O96018 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
APBA3O96018 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APBA3O96018 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APBA3O96018 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APBA3O96018 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APBA3O96018 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APBA3O96018 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APBA3O96018 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APBA3O96018 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APBA3O96018 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APBA3O96018 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APBA3O96018 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APBA3O96018 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APBA3O96018 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APBA3O96018 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APBA3O96018 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APBA3O96018 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APBA3O96018 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APBA3O96018 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APBA3O96018 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
APBA3O96018 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
APBA3O96018 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APBA3O96018 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APBA3O96018 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APBA3O96018 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APBA3O96018 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
APBA3O96018 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APBA3O96018 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APBA3O96018 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APBA3O96018 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
APBA3O96018 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APBA3O96018 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APBA3O96018 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APBA3O96018 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APBA3O96018 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APBA3O96018 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APBA3O96018 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APBA3O96018 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APBA3O96018 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APBA3O96018 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APBA3O96018 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APBA3O96018 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APBA3O96018 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APBA3O96018 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APBA3O96018 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APBA3O96018 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APBA3O96018 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APBA3O96018 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APBA3O96018 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APBA3O96018 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APBA3O96018 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APBA3O96018 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APBA3O96018 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APBA3O96018 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APBA3O96018 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
APBA3O96018 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APBA3O96018 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APBA3O96018 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APBA3O96018 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
APBA3O96018 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APBA3O96018 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APBA3O96018 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms