Protein–RNA interactions for Protein: O94972

TRIM37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, humanhuman

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM37O94972 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM37O94972 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM37O94972 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM37O94972 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM37O94972 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM37O94972 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM37O94972 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM37O94972 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM37O94972 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM37O94972 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM37O94972 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM37O94972 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM37O94972 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM37O94972 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM37O94972 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM37O94972 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM37O94972 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM37O94972 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM37O94972 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM37O94972 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM37O94972 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM37O94972 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM37O94972 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM37O94972 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM37O94972 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM37O94972 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM37O94972 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM37O94972 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM37O94972 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM37O94972 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM37O94972 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM37O94972 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM37O94972 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM37O94972 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM37O94972 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM37O94972 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM37O94972 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM37O94972 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM37O94972 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM37O94972 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM37O94972 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM37O94972 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM37O94972 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM37O94972 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM37O94972 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM37O94972 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM37O94972 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM37O94972 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM37O94972 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM37O94972 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM37O94972 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM37O94972 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM37O94972 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM37O94972 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM37O94972 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM37O94972 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM37O94972 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM37O94972 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM37O94972 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM37O94972 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM37O94972 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM37O94972 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM37O94972 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM37O94972 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM37O94972 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM37O94972 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM37O94972 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM37O94972 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM37O94972 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM37O94972 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM37O94972 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM37O94972 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM37O94972 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM37O94972 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM37O94972 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM37O94972 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM37O94972 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM37O94972 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM37O94972 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM37O94972 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM37O94972 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM37O94972 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM37O94972 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM37O94972 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM37O94972 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM37O94972 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM37O94972 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM37O94972 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM37O94972 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM37O94972 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM37O94972 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM37O94972 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM37O94972 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM37O94972 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM37O94972 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM37O94972 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM37O94972 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM37O94972 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM37O94972 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM37O94972 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms