Protein–RNA interactions for Protein: O94953

KDM4B, Lysine-specific demethylase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 1,096 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4BO94953 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KDM4BO94953 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KDM4BO94953 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KDM4BO94953 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KDM4BO94953 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KDM4BO94953 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KDM4BO94953 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KDM4BO94953 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KDM4BO94953 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KDM4BO94953 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KDM4BO94953 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KDM4BO94953 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KDM4BO94953 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KDM4BO94953 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KDM4BO94953 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KDM4BO94953 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KDM4BO94953 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KDM4BO94953 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KDM4BO94953 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KDM4BO94953 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KDM4BO94953 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KDM4BO94953 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KDM4BO94953 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KDM4BO94953 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KDM4BO94953 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KDM4BO94953 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KDM4BO94953 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KDM4BO94953 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KDM4BO94953 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KDM4BO94953 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KDM4BO94953 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KDM4BO94953 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KDM4BO94953 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KDM4BO94953 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KDM4BO94953 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KDM4BO94953 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KDM4BO94953 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KDM4BO94953 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KDM4BO94953 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KDM4BO94953 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KDM4BO94953 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KDM4BO94953 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KDM4BO94953 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KDM4BO94953 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KDM4BO94953 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KDM4BO94953 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KDM4BO94953 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KDM4BO94953 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KDM4BO94953 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KDM4BO94953 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KDM4BO94953 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KDM4BO94953 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KDM4BO94953 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KDM4BO94953 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KDM4BO94953 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KDM4BO94953 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KDM4BO94953 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KDM4BO94953 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KDM4BO94953 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KDM4BO94953 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KDM4BO94953 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KDM4BO94953 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KDM4BO94953 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KDM4BO94953 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KDM4BO94953 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KDM4BO94953 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KDM4BO94953 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KDM4BO94953 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KDM4BO94953 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KDM4BO94953 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KDM4BO94953 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KDM4BO94953 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KDM4BO94953 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KDM4BO94953 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KDM4BO94953 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KDM4BO94953 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KDM4BO94953 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KDM4BO94953 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KDM4BO94953 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KDM4BO94953 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KDM4BO94953 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KDM4BO94953 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KDM4BO94953 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KDM4BO94953 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KDM4BO94953 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KDM4BO94953 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KDM4BO94953 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KDM4BO94953 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KDM4BO94953 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KDM4BO94953 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KDM4BO94953 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KDM4BO94953 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KDM4BO94953 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KDM4BO94953 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KDM4BO94953 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KDM4BO94953 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KDM4BO94953 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KDM4BO94953 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KDM4BO94953 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KDM4BO94953 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms