Protein–RNA interactions for Protein: O94889

KLHL18, Kelch-like protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL18O94889 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL18O94889 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL18O94889 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL18O94889 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL18O94889 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL18O94889 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL18O94889 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL18O94889 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL18O94889 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL18O94889 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL18O94889 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL18O94889 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL18O94889 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL18O94889 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL18O94889 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL18O94889 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL18O94889 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL18O94889 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL18O94889 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL18O94889 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL18O94889 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL18O94889 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL18O94889 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL18O94889 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL18O94889 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL18O94889 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL18O94889 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL18O94889 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL18O94889 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL18O94889 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL18O94889 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL18O94889 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL18O94889 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL18O94889 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL18O94889 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL18O94889 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL18O94889 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL18O94889 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL18O94889 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL18O94889 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL18O94889 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL18O94889 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL18O94889 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL18O94889 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL18O94889 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL18O94889 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL18O94889 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL18O94889 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL18O94889 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL18O94889 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL18O94889 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL18O94889 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL18O94889 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL18O94889 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL18O94889 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL18O94889 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL18O94889 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL18O94889 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL18O94889 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL18O94889 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL18O94889 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL18O94889 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL18O94889 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL18O94889 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL18O94889 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL18O94889 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL18O94889 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL18O94889 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL18O94889 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL18O94889 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL18O94889 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL18O94889 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL18O94889 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL18O94889 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL18O94889 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL18O94889 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL18O94889 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL18O94889 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL18O94889 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL18O94889 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL18O94889 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL18O94889 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL18O94889 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL18O94889 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL18O94889 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL18O94889 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL18O94889 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL18O94889 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL18O94889 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL18O94889 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL18O94889 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL18O94889 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL18O94889 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL18O94889 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL18O94889 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL18O94889 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL18O94889 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL18O94889 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL18O94889 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL18O94889 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms