Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG12O94817 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG12O94817 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG12O94817 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG12O94817 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG12O94817 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG12O94817 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG12O94817 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG12O94817 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG12O94817 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG12O94817 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG12O94817 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG12O94817 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG12O94817 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG12O94817 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG12O94817 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG12O94817 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG12O94817 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG12O94817 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG12O94817 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG12O94817 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG12O94817 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG12O94817 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG12O94817 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG12O94817 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG12O94817 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG12O94817 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG12O94817 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG12O94817 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG12O94817 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG12O94817 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG12O94817 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG12O94817 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG12O94817 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG12O94817 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG12O94817 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG12O94817 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG12O94817 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG12O94817 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG12O94817 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG12O94817 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG12O94817 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG12O94817 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG12O94817 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG12O94817 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG12O94817 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG12O94817 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG12O94817 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG12O94817 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG12O94817 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG12O94817 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG12O94817 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG12O94817 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG12O94817 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG12O94817 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG12O94817 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG12O94817 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG12O94817 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG12O94817 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG12O94817 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG12O94817 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG12O94817 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG12O94817 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG12O94817 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG12O94817 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG12O94817 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG12O94817 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG12O94817 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG12O94817 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG12O94817 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG12O94817 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG12O94817 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG12O94817 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG12O94817 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG12O94817 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG12O94817 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG12O94817 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG12O94817 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG12O94817 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG12O94817 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG12O94817 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG12O94817 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG12O94817 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG12O94817 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG12O94817 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG12O94817 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG12O94817 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG12O94817 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG12O94817 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG12O94817 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG12O94817 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG12O94817 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG12O94817 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG12O94817 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG12O94817 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG12O94817 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG12O94817 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG12O94817 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG12O94817 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG12O94817 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms