Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PITX3O75364 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PITX3O75364 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PITX3O75364 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PITX3O75364 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PITX3O75364 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PITX3O75364 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PITX3O75364 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PITX3O75364 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PITX3O75364 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PITX3O75364 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PITX3O75364 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PITX3O75364 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PITX3O75364 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PITX3O75364 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PITX3O75364 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PITX3O75364 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PITX3O75364 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PITX3O75364 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PITX3O75364 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PITX3O75364 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PITX3O75364 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PITX3O75364 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PITX3O75364 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PITX3O75364 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PITX3O75364 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PITX3O75364 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PITX3O75364 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PITX3O75364 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PITX3O75364 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PITX3O75364 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PITX3O75364 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PITX3O75364 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PITX3O75364 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PITX3O75364 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PITX3O75364 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PITX3O75364 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PITX3O75364 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PITX3O75364 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PITX3O75364 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PITX3O75364 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PITX3O75364 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PITX3O75364 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PITX3O75364 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PITX3O75364 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PITX3O75364 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PITX3O75364 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PITX3O75364 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PITX3O75364 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PITX3O75364 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PITX3O75364 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PITX3O75364 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PITX3O75364 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PITX3O75364 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PITX3O75364 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PITX3O75364 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PITX3O75364 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PITX3O75364 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PITX3O75364 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PITX3O75364 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PITX3O75364 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PITX3O75364 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PITX3O75364 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PITX3O75364 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PITX3O75364 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PITX3O75364 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PITX3O75364 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PITX3O75364 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PITX3O75364 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PITX3O75364 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PITX3O75364 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PITX3O75364 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PITX3O75364 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PITX3O75364 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PITX3O75364 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PITX3O75364 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PITX3O75364 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PITX3O75364 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PITX3O75364 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PITX3O75364 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PITX3O75364 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PITX3O75364 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PITX3O75364 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PITX3O75364 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PITX3O75364 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PITX3O75364 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PITX3O75364 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PITX3O75364 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PITX3O75364 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PITX3O75364 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PITX3O75364 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PITX3O75364 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PITX3O75364 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PITX3O75364 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PITX3O75364 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PITX3O75364 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PITX3O75364 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PITX3O75364 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PITX3O75364 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PITX3O75364 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms