Protein–RNA interactions for Protein: O60885

BRD4, Bromodomain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD4O60885 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRD4O60885 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRD4O60885 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
BRD4O60885 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRD4O60885 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRD4O60885 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRD4O60885 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRD4O60885 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRD4O60885 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRD4O60885 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRD4O60885 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
BRD4O60885 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRD4O60885 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRD4O60885 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRD4O60885 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRD4O60885 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
BRD4O60885 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRD4O60885 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRD4O60885 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRD4O60885 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRD4O60885 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
BRD4O60885 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRD4O60885 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRD4O60885 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRD4O60885 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
BRD4O60885 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRD4O60885 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRD4O60885 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRD4O60885 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRD4O60885 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRD4O60885 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRD4O60885 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRD4O60885 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRD4O60885 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRD4O60885 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
BRD4O60885 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRD4O60885 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRD4O60885 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
BRD4O60885 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRD4O60885 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
BRD4O60885 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRD4O60885 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
BRD4O60885 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
BRD4O60885 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRD4O60885 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRD4O60885 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRD4O60885 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRD4O60885 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRD4O60885 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRD4O60885 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRD4O60885 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRD4O60885 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRD4O60885 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRD4O60885 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRD4O60885 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRD4O60885 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRD4O60885 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRD4O60885 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRD4O60885 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRD4O60885 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRD4O60885 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRD4O60885 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRD4O60885 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRD4O60885 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRD4O60885 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRD4O60885 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
BRD4O60885 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRD4O60885 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
BRD4O60885 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRD4O60885 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRD4O60885 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRD4O60885 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRD4O60885 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRD4O60885 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRD4O60885 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRD4O60885 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRD4O60885 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRD4O60885 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRD4O60885 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRD4O60885 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRD4O60885 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
BRD4O60885 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRD4O60885 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRD4O60885 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRD4O60885 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRD4O60885 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
BRD4O60885 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRD4O60885 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRD4O60885 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRD4O60885 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRD4O60885 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
BRD4O60885 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRD4O60885 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRD4O60885 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRD4O60885 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRD4O60885 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRD4O60885 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRD4O60885 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
BRD4O60885 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
BRD4O60885 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms