Protein–RNA interactions for Protein: O60361

NME2P1, Putative nucleoside diphosphate kinase, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME2P1O60361 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME2P1O60361 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME2P1O60361 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME2P1O60361 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME2P1O60361 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME2P1O60361 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME2P1O60361 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME2P1O60361 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME2P1O60361 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME2P1O60361 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME2P1O60361 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME2P1O60361 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME2P1O60361 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME2P1O60361 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME2P1O60361 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME2P1O60361 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME2P1O60361 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME2P1O60361 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME2P1O60361 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NME2P1O60361 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME2P1O60361 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME2P1O60361 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME2P1O60361 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME2P1O60361 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME2P1O60361 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME2P1O60361 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NME2P1O60361 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME2P1O60361 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NME2P1O60361 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME2P1O60361 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME2P1O60361 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME2P1O60361 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NME2P1O60361 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NME2P1O60361 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME2P1O60361 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME2P1O60361 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME2P1O60361 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME2P1O60361 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME2P1O60361 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME2P1O60361 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME2P1O60361 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME2P1O60361 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME2P1O60361 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME2P1O60361 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME2P1O60361 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME2P1O60361 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME2P1O60361 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME2P1O60361 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME2P1O60361 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME2P1O60361 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME2P1O60361 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME2P1O60361 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME2P1O60361 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME2P1O60361 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME2P1O60361 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME2P1O60361 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME2P1O60361 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME2P1O60361 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME2P1O60361 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME2P1O60361 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME2P1O60361 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME2P1O60361 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NME2P1O60361 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NME2P1O60361 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NME2P1O60361 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME2P1O60361 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME2P1O60361 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NME2P1O60361 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NME2P1O60361 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME2P1O60361 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NME2P1O60361 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NME2P1O60361 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME2P1O60361 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME2P1O60361 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME2P1O60361 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME2P1O60361 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME2P1O60361 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME2P1O60361 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME2P1O60361 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME2P1O60361 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME2P1O60361 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME2P1O60361 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME2P1O60361 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME2P1O60361 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME2P1O60361 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME2P1O60361 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME2P1O60361 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME2P1O60361 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME2P1O60361 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME2P1O60361 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME2P1O60361 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME2P1O60361 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME2P1O60361 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME2P1O60361 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME2P1O60361 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME2P1O60361 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME2P1O60361 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME2P1O60361 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME2P1O60361 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME2P1O60361 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms