Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
KIAA0556O60303 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
KIAA0556O60303 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KIAA0556O60303 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KIAA0556O60303 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KIAA0556O60303 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
KIAA0556O60303 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KIAA0556O60303 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
KIAA0556O60303 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
KIAA0556O60303 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
KIAA0556O60303 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
KIAA0556O60303 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KIAA0556O60303 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
KIAA0556O60303 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KIAA0556O60303 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
KIAA0556O60303 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KIAA0556O60303 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
KIAA0556O60303 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
KIAA0556O60303 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
KIAA0556O60303 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
KIAA0556O60303 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
KIAA0556O60303 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
KIAA0556O60303 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
KIAA0556O60303 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
KIAA0556O60303 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
KIAA0556O60303 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
KIAA0556O60303 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
KIAA0556O60303 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
KIAA0556O60303 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
KIAA0556O60303 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
KIAA0556O60303 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
KIAA0556O60303 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
KIAA0556O60303 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
KIAA0556O60303 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
KIAA0556O60303 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
KIAA0556O60303 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
KIAA0556O60303 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
KIAA0556O60303 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
KIAA0556O60303 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
KIAA0556O60303 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
KIAA0556O60303 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
KIAA0556O60303 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
KIAA0556O60303 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
KIAA0556O60303 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
KIAA0556O60303 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
KIAA0556O60303 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
KIAA0556O60303 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
KIAA0556O60303 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
KIAA0556O60303 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
KIAA0556O60303 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
KIAA0556O60303 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
KIAA0556O60303 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
KIAA0556O60303 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
KIAA0556O60303 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
KIAA0556O60303 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
KIAA0556O60303 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
KIAA0556O60303 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
KIAA0556O60303 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
KIAA0556O60303 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
KIAA0556O60303 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
KIAA0556O60303 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms