Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HTATSF1O43719 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms