Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLGNO14967 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLGNO14967 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLGNO14967 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLGNO14967 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLGNO14967 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLGNO14967 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLGNO14967 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLGNO14967 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLGNO14967 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CLGNO14967 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLGNO14967 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLGNO14967 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLGNO14967 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLGNO14967 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLGNO14967 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLGNO14967 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLGNO14967 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLGNO14967 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLGNO14967 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLGNO14967 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLGNO14967 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLGNO14967 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLGNO14967 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLGNO14967 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLGNO14967 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLGNO14967 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLGNO14967 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLGNO14967 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLGNO14967 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLGNO14967 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLGNO14967 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLGNO14967 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CLGNO14967 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLGNO14967 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLGNO14967 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLGNO14967 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLGNO14967 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLGNO14967 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLGNO14967 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLGNO14967 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLGNO14967 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLGNO14967 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLGNO14967 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLGNO14967 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLGNO14967 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLGNO14967 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLGNO14967 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLGNO14967 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLGNO14967 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLGNO14967 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLGNO14967 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLGNO14967 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLGNO14967 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CLGNO14967 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLGNO14967 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CLGNO14967 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLGNO14967 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLGNO14967 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CLGNO14967 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLGNO14967 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLGNO14967 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLGNO14967 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLGNO14967 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLGNO14967 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLGNO14967 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLGNO14967 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLGNO14967 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLGNO14967 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CLGNO14967 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLGNO14967 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLGNO14967 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLGNO14967 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CLGNO14967 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLGNO14967 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLGNO14967 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLGNO14967 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLGNO14967 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLGNO14967 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLGNO14967 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLGNO14967 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLGNO14967 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLGNO14967 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLGNO14967 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLGNO14967 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLGNO14967 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLGNO14967 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLGNO14967 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLGNO14967 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLGNO14967 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLGNO14967 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLGNO14967 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLGNO14967 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLGNO14967 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLGNO14967 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLGNO14967 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLGNO14967 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLGNO14967 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CLGNO14967 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CLGNO14967 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms