Protein–RNA interactions for Protein: C9JLJ4

USP17L13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L13C9JLJ4 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
USP17L13C9JLJ4 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
USP17L13C9JLJ4 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms