Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
B4DXG7 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
B4DXG7 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
B4DXG7 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
B4DXG7 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
B4DXG7 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
B4DXG7 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
B4DXG7 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
B4DXG7 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
B4DXG7 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
B4DXG7 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
B4DXG7 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
B4DXG7 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
B4DXG7 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
B4DXG7 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
B4DXG7 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
B4DXG7 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
B4DXG7 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
B4DXG7 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
B4DXG7 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
B4DXG7 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
B4DXG7 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
B4DXG7 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
B4DXG7 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
B4DXG7 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
B4DXG7 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
B4DXG7 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
B4DXG7 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
B4DXG7 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
B4DXG7 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
B4DXG7 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
B4DXG7 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
B4DXG7 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
B4DXG7 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
B4DXG7 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
B4DXG7 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
B4DXG7 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
B4DXG7 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
B4DXG7 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
B4DXG7 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
B4DXG7 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
B4DXG7 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
B4DXG7 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
B4DXG7 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
B4DXG7 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
B4DXG7 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
B4DXG7 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
B4DXG7 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
B4DXG7 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
B4DXG7 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
B4DXG7 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
B4DXG7 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
B4DXG7 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
B4DXG7 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
B4DXG7 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
B4DXG7 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
B4DXG7 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
B4DXG7 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
B4DXG7 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
B4DXG7 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
B4DXG7 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
B4DXG7 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
B4DXG7 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
B4DXG7 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
B4DXG7 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
B4DXG7 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
B4DXG7 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
B4DXG7 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
B4DXG7 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
B4DXG7 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
B4DXG7 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
B4DXG7 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
B4DXG7 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
B4DXG7 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
B4DXG7 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
B4DXG7 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
B4DXG7 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
B4DXG7 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
B4DXG7 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
B4DXG7 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
B4DXG7 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
B4DXG7 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
B4DXG7 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
B4DXG7 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
B4DXG7 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
B4DXG7 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
B4DXG7 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
B4DXG7 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
B4DXG7 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
B4DXG7 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
B4DXG7 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
B4DXG7 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
B4DXG7 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
B4DXG7 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
B4DXG7 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
B4DXG7 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
B4DXG7 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
B4DXG7 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
B4DXG7 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
B4DXG7 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms