Protein–RNA interactions for Protein: B4DGG1

cDNA FLJ60496, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DGG1 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
B4DGG1 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
B4DGG1 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
B4DGG1 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
B4DGG1 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
B4DGG1 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
B4DGG1 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
B4DGG1 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
B4DGG1 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
B4DGG1 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
B4DGG1 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
B4DGG1 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
B4DGG1 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
B4DGG1 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
B4DGG1 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
B4DGG1 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
B4DGG1 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
B4DGG1 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
B4DGG1 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
B4DGG1 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
B4DGG1 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
B4DGG1 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
B4DGG1 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
B4DGG1 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
B4DGG1 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
B4DGG1 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
B4DGG1 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
B4DGG1 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
B4DGG1 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
B4DGG1 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
B4DGG1 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
B4DGG1 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
B4DGG1 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
B4DGG1 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
B4DGG1 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
B4DGG1 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
B4DGG1 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
B4DGG1 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
B4DGG1 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
B4DGG1 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
B4DGG1 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
B4DGG1 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
B4DGG1 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
B4DGG1 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
B4DGG1 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
B4DGG1 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
B4DGG1 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
B4DGG1 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
B4DGG1 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
B4DGG1 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
B4DGG1 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
B4DGG1 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
B4DGG1 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
B4DGG1 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
B4DGG1 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
B4DGG1 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
B4DGG1 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
B4DGG1 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
B4DGG1 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
B4DGG1 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
B4DGG1 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
B4DGG1 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
B4DGG1 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
B4DGG1 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
B4DGG1 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
B4DGG1 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
B4DGG1 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
B4DGG1 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
B4DGG1 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
B4DGG1 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
B4DGG1 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
B4DGG1 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
B4DGG1 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
B4DGG1 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
B4DGG1 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
B4DGG1 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
B4DGG1 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
B4DGG1 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
B4DGG1 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
B4DGG1 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
B4DGG1 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
B4DGG1 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
B4DGG1 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
B4DGG1 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
B4DGG1 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
B4DGG1 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
B4DGG1 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
B4DGG1 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
B4DGG1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
B4DGG1 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
B4DGG1 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
B4DGG1 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
B4DGG1 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
B4DGG1 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
B4DGG1 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
B4DGG1 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
B4DGG1 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
B4DGG1 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
B4DGG1 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
B4DGG1 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms