Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
STRCP1A6NGW2 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms