Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC160A6NGH7 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms