Protein–RNA interactions for Protein: A6NFY4

NEMP2, Nuclear envelope integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP2A6NFY4 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEMP2A6NFY4 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEMP2A6NFY4 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms