Protein–RNA interactions for Protein: A6NE82

MBD3L3, Putative methyl-CpG-binding domain protein 3-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3L3A6NE82 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MBD3L3A6NE82 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MBD3L3A6NE82 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MBD3L3A6NE82 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MBD3L3A6NE82 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MBD3L3A6NE82 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MBD3L3A6NE82 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MBD3L3A6NE82 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MBD3L3A6NE82 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MBD3L3A6NE82 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MBD3L3A6NE82 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MBD3L3A6NE82 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MBD3L3A6NE82 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MBD3L3A6NE82 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MBD3L3A6NE82 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD3L3A6NE82 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD3L3A6NE82 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD3L3A6NE82 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD3L3A6NE82 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD3L3A6NE82 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD3L3A6NE82 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD3L3A6NE82 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD3L3A6NE82 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD3L3A6NE82 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD3L3A6NE82 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD3L3A6NE82 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD3L3A6NE82 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD3L3A6NE82 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD3L3A6NE82 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD3L3A6NE82 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD3L3A6NE82 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD3L3A6NE82 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD3L3A6NE82 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD3L3A6NE82 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD3L3A6NE82 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD3L3A6NE82 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD3L3A6NE82 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD3L3A6NE82 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD3L3A6NE82 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD3L3A6NE82 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD3L3A6NE82 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD3L3A6NE82 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD3L3A6NE82 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD3L3A6NE82 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD3L3A6NE82 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD3L3A6NE82 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD3L3A6NE82 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD3L3A6NE82 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MBD3L3A6NE82 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MBD3L3A6NE82 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MBD3L3A6NE82 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MBD3L3A6NE82 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MBD3L3A6NE82 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MBD3L3A6NE82 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MBD3L3A6NE82 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MBD3L3A6NE82 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MBD3L3A6NE82 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MBD3L3A6NE82 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MBD3L3A6NE82 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MBD3L3A6NE82 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MBD3L3A6NE82 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MBD3L3A6NE82 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
MBD3L3A6NE82 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MBD3L3A6NE82 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MBD3L3A6NE82 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MBD3L3A6NE82 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MBD3L3A6NE82 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
MBD3L3A6NE82 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MBD3L3A6NE82 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MBD3L3A6NE82 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD3L3A6NE82 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD3L3A6NE82 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD3L3A6NE82 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD3L3A6NE82 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD3L3A6NE82 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD3L3A6NE82 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD3L3A6NE82 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD3L3A6NE82 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD3L3A6NE82 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD3L3A6NE82 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD3L3A6NE82 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD3L3A6NE82 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD3L3A6NE82 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD3L3A6NE82 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD3L3A6NE82 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD3L3A6NE82 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD3L3A6NE82 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD3L3A6NE82 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD3L3A6NE82 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD3L3A6NE82 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD3L3A6NE82 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD3L3A6NE82 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD3L3A6NE82 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD3L3A6NE82 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD3L3A6NE82 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD3L3A6NE82 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD3L3A6NE82 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD3L3A6NE82 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD3L3A6NE82 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD3L3A6NE82 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms