Protein–RNA interactions for Protein: A6NDA9

LRIT2, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT2A6NDA9 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LRIT2A6NDA9 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRIT2A6NDA9 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRIT2A6NDA9 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRIT2A6NDA9 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRIT2A6NDA9 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRIT2A6NDA9 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRIT2A6NDA9 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LRIT2A6NDA9 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRIT2A6NDA9 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRIT2A6NDA9 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRIT2A6NDA9 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRIT2A6NDA9 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRIT2A6NDA9 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRIT2A6NDA9 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRIT2A6NDA9 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRIT2A6NDA9 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIT2A6NDA9 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIT2A6NDA9 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIT2A6NDA9 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIT2A6NDA9 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIT2A6NDA9 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIT2A6NDA9 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIT2A6NDA9 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIT2A6NDA9 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIT2A6NDA9 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIT2A6NDA9 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIT2A6NDA9 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIT2A6NDA9 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIT2A6NDA9 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIT2A6NDA9 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIT2A6NDA9 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIT2A6NDA9 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIT2A6NDA9 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIT2A6NDA9 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIT2A6NDA9 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIT2A6NDA9 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIT2A6NDA9 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIT2A6NDA9 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIT2A6NDA9 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIT2A6NDA9 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIT2A6NDA9 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIT2A6NDA9 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIT2A6NDA9 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIT2A6NDA9 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIT2A6NDA9 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIT2A6NDA9 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIT2A6NDA9 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIT2A6NDA9 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIT2A6NDA9 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIT2A6NDA9 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRIT2A6NDA9 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRIT2A6NDA9 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRIT2A6NDA9 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRIT2A6NDA9 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRIT2A6NDA9 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRIT2A6NDA9 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRIT2A6NDA9 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRIT2A6NDA9 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRIT2A6NDA9 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRIT2A6NDA9 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRIT2A6NDA9 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRIT2A6NDA9 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRIT2A6NDA9 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRIT2A6NDA9 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LRIT2A6NDA9 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRIT2A6NDA9 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRIT2A6NDA9 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRIT2A6NDA9 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRIT2A6NDA9 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRIT2A6NDA9 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRIT2A6NDA9 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LRIT2A6NDA9 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRIT2A6NDA9 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRIT2A6NDA9 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRIT2A6NDA9 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRIT2A6NDA9 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRIT2A6NDA9 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRIT2A6NDA9 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRIT2A6NDA9 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRIT2A6NDA9 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRIT2A6NDA9 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRIT2A6NDA9 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRIT2A6NDA9 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRIT2A6NDA9 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRIT2A6NDA9 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRIT2A6NDA9 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRIT2A6NDA9 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRIT2A6NDA9 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRIT2A6NDA9 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRIT2A6NDA9 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRIT2A6NDA9 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRIT2A6NDA9 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRIT2A6NDA9 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRIT2A6NDA9 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRIT2A6NDA9 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LRIT2A6NDA9 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRIT2A6NDA9 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRIT2A6NDA9 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LRIT2A6NDA9 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms