Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP17L4A6NCW7 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms