Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC78A2IDD5 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms