Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPDC1A2A3K4 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPDC1A2A3K4 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPDC1A2A3K4 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPDC1A2A3K4 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPDC1A2A3K4 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPDC1A2A3K4 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPDC1A2A3K4 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPDC1A2A3K4 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPDC1A2A3K4 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPDC1A2A3K4 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPDC1A2A3K4 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPDC1A2A3K4 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPDC1A2A3K4 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPDC1A2A3K4 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPDC1A2A3K4 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPDC1A2A3K4 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPDC1A2A3K4 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPDC1A2A3K4 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPDC1A2A3K4 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms