Protein–RNA interactions for Protein: W5XKT8

SPACA6, Sperm acrosome membrane-associated protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPACA6W5XKT8 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SPACA6W5XKT8 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPACA6W5XKT8 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPACA6W5XKT8 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPACA6W5XKT8 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPACA6W5XKT8 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SPACA6W5XKT8 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPACA6W5XKT8 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPACA6W5XKT8 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPACA6W5XKT8 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPACA6W5XKT8 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SPACA6W5XKT8 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPACA6W5XKT8 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPACA6W5XKT8 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPACA6W5XKT8 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPACA6W5XKT8 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPACA6W5XKT8 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SPACA6W5XKT8 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPACA6W5XKT8 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPACA6W5XKT8 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPACA6W5XKT8 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPACA6W5XKT8 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPACA6W5XKT8 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPACA6W5XKT8 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPACA6W5XKT8 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPACA6W5XKT8 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPACA6W5XKT8 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPACA6W5XKT8 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPACA6W5XKT8 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPACA6W5XKT8 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPACA6W5XKT8 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPACA6W5XKT8 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SPACA6W5XKT8 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SPACA6W5XKT8 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SPACA6W5XKT8 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SPACA6W5XKT8 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPACA6W5XKT8 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPACA6W5XKT8 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPACA6W5XKT8 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPACA6W5XKT8 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPACA6W5XKT8 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPACA6W5XKT8 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPACA6W5XKT8 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SPACA6W5XKT8 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPACA6W5XKT8 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPACA6W5XKT8 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPACA6W5XKT8 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPACA6W5XKT8 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPACA6W5XKT8 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPACA6W5XKT8 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPACA6W5XKT8 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPACA6W5XKT8 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPACA6W5XKT8 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPACA6W5XKT8 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPACA6W5XKT8 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPACA6W5XKT8 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPACA6W5XKT8 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPACA6W5XKT8 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPACA6W5XKT8 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPACA6W5XKT8 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPACA6W5XKT8 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPACA6W5XKT8 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPACA6W5XKT8 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPACA6W5XKT8 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPACA6W5XKT8 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPACA6W5XKT8 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPACA6W5XKT8 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPACA6W5XKT8 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPACA6W5XKT8 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SPACA6W5XKT8 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPACA6W5XKT8 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPACA6W5XKT8 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SPACA6W5XKT8 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SPACA6W5XKT8 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPACA6W5XKT8 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPACA6W5XKT8 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SPACA6W5XKT8 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SPACA6W5XKT8 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPACA6W5XKT8 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPACA6W5XKT8 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPACA6W5XKT8 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPACA6W5XKT8 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPACA6W5XKT8 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPACA6W5XKT8 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPACA6W5XKT8 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPACA6W5XKT8 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPACA6W5XKT8 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPACA6W5XKT8 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPACA6W5XKT8 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPACA6W5XKT8 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPACA6W5XKT8 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPACA6W5XKT8 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPACA6W5XKT8 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPACA6W5XKT8 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPACA6W5XKT8 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPACA6W5XKT8 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPACA6W5XKT8 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPACA6W5XKT8 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPACA6W5XKT8 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPACA6W5XKT8 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms