Protein–RNA interactions for Protein: V9GYY9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 64 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYY9 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
V9GYY9 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
V9GYY9 DLX1-201ENST00000341900 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
V9GYY9 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
V9GYY9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
V9GYY9 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
V9GYY9 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
V9GYY9 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
V9GYY9 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
V9GYY9 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
V9GYY9 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
V9GYY9 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
V9GYY9 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
V9GYY9 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
V9GYY9 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
V9GYY9 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
V9GYY9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
V9GYY9 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
V9GYY9 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
V9GYY9 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
V9GYY9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
V9GYY9 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
V9GYY9 LINC01749-202ENST00000607802 3408 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
V9GYY9 LOXL4-201ENST00000260702 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
V9GYY9 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
V9GYY9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
V9GYY9 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
V9GYY9 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
V9GYY9 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
V9GYY9 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
V9GYY9 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
V9GYY9 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
V9GYY9 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
V9GYY9 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
V9GYY9 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
V9GYY9 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
V9GYY9 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
V9GYY9 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
V9GYY9 PIM1-201ENST00000373509 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
V9GYY9 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
V9GYY9 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
V9GYY9 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
V9GYY9 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.25□□□□□ -0.77
V9GYY9 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
V9GYY9 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
V9GYY9 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
V9GYY9 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
V9GYY9 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
V9GYY9 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
V9GYY9 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
V9GYY9 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
V9GYY9 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
V9GYY9 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
V9GYY9 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
V9GYY9 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
V9GYY9 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
V9GYY9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
V9GYY9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
V9GYY9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
V9GYY9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
V9GYY9 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
V9GYY9 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
V9GYY9 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
V9GYY9 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
V9GYY9 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
V9GYY9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
V9GYY9 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
V9GYY9 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
V9GYY9 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
V9GYY9 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
V9GYY9 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
V9GYY9 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
V9GYY9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
V9GYY9 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
V9GYY9 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
V9GYY9 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
V9GYY9 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
V9GYY9 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
V9GYY9 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
V9GYY9 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
V9GYY9 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
V9GYY9 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
V9GYY9 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
V9GYY9 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
V9GYY9 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
V9GYY9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
V9GYY9 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
V9GYY9 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
V9GYY9 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
V9GYY9 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
V9GYY9 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
V9GYY9 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
V9GYY9 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
V9GYY9 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
V9GYY9 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
V9GYY9 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
V9GYY9 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
V9GYY9 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
V9GYY9 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
V9GYY9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms