Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Z2

LINC01558, Uncharacterized protein encoded by LINC01558, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01558Q9Y6Z2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms