Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC4A4Q9Y6R1 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC4A4Q9Y6R1 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC4A4Q9Y6R1 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC4A4Q9Y6R1 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC4A4Q9Y6R1 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC4A4Q9Y6R1 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC4A4Q9Y6R1 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC4A4Q9Y6R1 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC4A4Q9Y6R1 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC4A4Q9Y6R1 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC4A4Q9Y6R1 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC4A4Q9Y6R1 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC4A4Q9Y6R1 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms